Автофокусировка в режиме live view и через видоискатель использует разные технологии. В режиме реального времени камера пытается получить наилучший контраст для изображения. AF видоискателя использует технологию определения фазы, которая включает в себя специальное оборудование в вашей камере.
Если видоискатель-AF не работает, возможно, у вас проблема с аппаратным обеспечением вашей камеры. Или вы, возможно, перевели объектив в ручной режим (ну, я полагаю, это также отключило бы автофокусировку в режиме live-view).
Ваш дилер может помочь вам в диагностике проблемы.