Нет, вы не можете.
Плагины Nik Lightroom потребуют от вас экспорта файлов в формат TIFF. На самом деле все, что вы оставляете Lightroom для работы в Photoshop, потребует перехода из RAW в TIFF.
После этого вы получите два файла: необработанный файл со всеми неразрушающими правками, выполненными до того, как вы использовали плагин Nik, и TIFF, содержащий кумулятивные правки, сделанные в raw, а затем плагином. Но вы не можете вернуться в LR и увидеть какие-либо изменения плагинов в необработанном файле, с этого момента вам придется работать с TIFF.
Программное обеспечение Nikon Capture NX2 (также написанное Ником) имело лучшую интеграцию с плагинами Nik - я помню, что некоторые вещи можно было сделать с помощью raw, но даже там я думаю, что большинство фильтров требовало генерации файла TIFF.