Как быть уверенным, что сканер (Nikon Coolscan 4000) фокусируется правильно, а если нет, как я могу вручную сфокусировать его с помощью Vuescan?
На вкладке ввода есть опция фокус и автофокус в Vuescan.
+ много экспериментов. Не забывайте регулярно сохранять настройки таким образом, чтобы вы могли запомнить, какие они есть.