Если предположить, что параметры в обоих файлах одинаковы (т. Е. Самое высокое качество), и вы не увеличиваете или не уменьшаете фотографии, результирующий вывод должен быть эффективно точно для обеих проблем. Нельзя сказать, что если вы сделали diff для файлов, они были бы одинаковыми, но с точки зрения качества изображения и привлекательности глаз вы не сможете заметить разницу.
Тем не менее, если вы увеличиваете или уменьшаете фотографии и выполняете другие манипуляции с ними, вы будете склонны видеть различия, потому что программы, как правило, используют немного другие (или значительно отличающиеся, если у них есть патент!) Алгоритмы для масштабирования и других операций, которые вы делаете с фотографией. Однако в этот момент я бы сказал, что вам следует использовать программное обеспечение, которое, по вашему мнению, лучше всего подходит для вашего рабочего процесса, и чьи результаты лучше всего подходят для ваших действий. Если вам нужно точное воспроизведение чего-либо, вам нужно будет ограничить любые манипуляции, которые вы делаете, и в этом случае мы возвращаемся к вопросу о том, что вывод JPEG фактически одинаков.