Я делаю это по-своему в GIMP - я беру «Свободный инструмент выбора», выбираю часть, которую хочу изменить. Затем я растушевываю края выделения на 30-100px в зависимости от размера выделения (чаще всего я выбираю 50px), затем копирую выделенное выделение и пропускаю его как новый слой. Таким образом, я могу внести любые изменения в этот конкретный бит, а остальная часть изображения останется нетронутой.
Для обработки изображения таким способом требуется время, но это позволяет мне достичь желаемых результатов, поэтому мне нравится работать так.