Нет, то, что вы описываете, в настоящее время невозможно с набором функций в Adobe Lightroom 3. Единственный инструмент типа клонирования - это инструмент для удаления пятен, который, как вы заметили, имеет круглую форму. Можно изменить размер инструмента, но это всегда круг.
В то время как Lightroom может (и выполняет) большую часть функций редактирования многих фотографов, клонирование является одной из причин, по которой я добавлю изображение в Photoshop.