Нет. Все в порядке; Я не могу представить, почему может быть проблема. Автоматическая очистка датчика обычно работает путем небольшого встряхивания датчика на высокой частоте. Это не приближается к объективу (по крайней мере, не больше, чем датчик). Я полагаю, что в некоторой степени возможно, что пыль может попасть в задний элемент объектива, но это нормально - это легко чистить.
Для многих камер можно установить (или даже по умолчанию) автоматическую очистку, когда камера включена, или выключена, или и то, и другое. Трудно представить, что производители камер ожидают, что в это время не будет установлен объектив (на самом деле, наоборот), поэтому мы точно знаем, что он предназначен для такой работы.