Я предполагаю, что это связано с двумя наложениями, которые были слегка смещены относительно друг друга, так что небольшие изменения в каждом изображении из-за матрицы Байера становятся очевидными.
Если это так, то это редкий случай, когда работа в сыром виде действительно мешает. Другими словами, исходные данные имеют некоторое регулярное высокочастотное содержимое благодаря матрице Байера. Обычно вы этого не видите и не заботитесь, потому что частота высокая. Однако, если вы объединяете две версии изображения, в которых одна шкала немного отличается от другой, вы получаете низкочастотный импульсный сигнал.
Чтобы исправить это, лучший ответ - не пытаться объединить две версии изображения, которые имеют очень небольшие различия в их масштабе. Ваше описание является расплывчатым в том, что вы на самом деле сделали, но если вы комбинируете два отдельных изображения, возможно, размеры вашего датчика очень мало изменились между двумя изображениями из-за изменения температуры. Это применимо только в том случае, если вы раздельно масштабировали две картинки, чтобы перекрыть их. Высокочастотный байеровский шум любых двух необработанных изображений с вашей камеры был бы одинаковым, даже если угол обзора, который они представляли, слегка изменился из-за изменения размеров.
Попробуйте отфильтровать каждое изображение в 2 раза, прежде чем создавать композиции. Это должно исключить высокие частоты Байера, чтобы после компоновки не было биений.