Если я что-то упустил, если ваш последний шаг перед повышением резкости состоит в том, чтобы скопировать все предыдущие слои и объединить их в один новый слой ... тогда вам нужно только применить повышение резкости к этому последнему слою.
Природа алгоритмов повышения резкости, как правило, не позволяет им беспрепятственно работать на нескольких уровнях. Даже если они сделали, я не уверен, почему вы видите необходимость. Вы уже явно подготовили слой для процесса повышения резкости, поэтому вам не нужно беспокоиться о межслойной резкости.
Без более четкого объяснения вашего рабочего процесса постобработки и целей, которые вы ставите перед собой, когда дело доходит до повышения резкости, я не могу действительно предложить гораздо больше в плане ответа. Вы пытаетесь достичь некоторого уровня неразрушающего редактирования в CS5?